曾经花了很多时间来选择和处理关于文档的编辑和处理工具。稍前一段时间选择的是r＋markdown，其中有些问题没有很好的处理方法，比如作图问题，表格导出到不同的格式的问题。
现在算是找到了一个好的解决方案，即emacs的org－mode。这里基本上可以解决上面的问题。而且前面关于R＋markdown的只是基本上这里也能用，但是可配置性更强。
1 一般的格式问题
可以参考文档 org-mode中的文字格式
2 源码处理问题
一般的问题可以参考 org-mode中的源码处理
3 插图问题
3.1 一般的统计作图
可以使用R语言。简单的实例可以参考 org-mode中的源码处理 。
3.2 流程图作图
可以使用dot来解决，简单的例子如下所示：
digraph {
A->B
B->C
C->A
开始 -> 结束 -> 检验
}
dot的文档 ： The DOT Language
更多文档： graphviz doc
graph : [ strict ] (graph | digraph) [ ID ] '{' stmt_list '}'
stmt_list : [ stmt [ ';' ] stmt_list ]
stmt : node_stmt
| edge_stmt
| attr_stmt
| ID '=' ID
| subgraph
attr_stmt : (graph | node | edge) attr_list
attr_list : '[' [ a_list ] ']' [ attr_list ]
a_list : ID '=' ID [ (';' | ',') ] [ a_list ]
edge_stmt : (node_id | subgraph) edgeRHS [ attr_list ]
edgeRHS : edgeop (node_id | subgraph) [ edgeRHS ]
node_stmt : node_id [ attr_list ]
node_id : ID [ port ]
port : ':' ID [ ':' compass_pt ]
| ':' compass_pt
subgraph : [ subgraph [ ID ] ] '{' stmt_list '}'
compass_pt : (n | ne | e | se | s | sw | w | nw | c | _)
3.3 精细的数学作图
可以使用tikz包来实现， 简单的实例可参考 org-mode中使用tikz画图 。
tikz的文档 texdoc tikz
4 表格
关于表格的问题，可以直接利用R语言的dataframe输出，然后加上 :colnames yes 即可以添加表头。实例在 org-mode中的源码处理 中有出现。
关于表格，还可以参考文章 org-mode中的表格。
另外，也可以直接使用org模式中的org-table，这个也很好用，而且可以象excel那样进行表格的计算。并且表格的计算中可以调用emacs lisp的函数来进行计算，因此功能很强大。表格的计算也可以参考 org-mode中的表格。
5 待解决的问题
现在还有一个没有同样解决方案的是r＋markdown中的R代码和计算结果交织的输出形式。目前org mode中的输出模式是R代码放在一起，输出结果放在另一块，并没有交织输出的模式。
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